הביטוח הלאומי מפעיל מערך חקירות הפועל בפריסה ארצית, ומונה כ- 140 חוקרים.
חוקרי הביטוח הלאומי פועלים לאתר ולחשוף חשד למעשי מרמה, במטרה למנוע ניצול לרעה של כספי המוסד לביטוח לאומי.
החוקרים מאתרים מבוטחים שמקבלים את הקצבה במרמה תוך הצגת נתונים כוזבים, ופועלים נגד מעסיקים שמתחמקים מתשלומי דמי ביטוח עבור עובדיהם בניגוד לחוק.
באגף קיימת יחידה ארצית לחקירות הונאה הפרוסה בשלוש חוליות: צפון,
מרכז ודרום. היחידה מיועדת לביצוע חקירות
מורכבות ופרשיות ולביצוע חקירות בשיתוף פעולה עם צוותי חקירה מרשויות אכיפה אחרות, כגון,
משטרת ישראל, רשות המיסים וכו'.
במערך החקירות מפעילים מערך מודיעין לאיתור מקרים, שבהם ישנם חשדות למרמה וביצוע עבירות על
חוק הביטוח הלאומי והחוקים שהמוסד אמון על ביצועם. המודיעין נותן שירותים ומידע לחוקרי האגף ולמנהלי הגבייה
והגמלאות.